在60多年的临床实践中，许教授坚决主张中医辨证必须与西医辨病相结合，宏观与微观结合，整体与局部相结合的观点，以求全面认识疾病，防治疾病。在具体应用上，有以下6个结合点：①利用西医的先进检查手段，确定疾病的诊断，然后辨证分型，因人而异地实行个体化治疗；②对各种慢性病，在辨证处方的基础上，根据病理组织学的改变，如慢性炎细胞浸润、纤维组织增生、微循环障碍等共性特点，加用2～3味活血化瘀药；③对于老年病患者，提出“多脏腑损害，多功能不足”的诊治观点；④对于各种感染性疾病，在辨证处方时根据西医不同的病因，加用对某种细菌或病毒敏感的中药2～3味；⑤根据内窥镜下的形态变化，加用合适的中药治疗；⑥对诊断不明的疾病，可用中医的思维方法，辨证论治，灵活应用《伤寒论》和《温热论》的方药，可获得较好的疗效。总之，通过结合点的思路，实行病证结合，可以达到病证同治到病证同愈的目的。
1995年，许教授提出中医辨证应与西医病理过程（病理、生理学改变）相结合来探讨“证”的本质。从病理、生理学入手，将“病证结合”研究模式引向机体的功能、结构、代谢统一性上探讨。要达到这个目的，我们应充分运用现代医学，特别是病理生理学及整体医学（Holistic Medicine）的思想，阐释“证”的本质，探究“病证结合”模式的病理生理学基础，为中西两种医学在理论上整体融合开拓新的思路与方法。