我国医疗保险制度经历了一个长期认识、不断探索到逐步完善的过程，从1994年江苏镇江、江西九江的职工医疗保险制度改革试点开始到1998年国务院颁布《关于建立城镇职工基本医疗保险制度的决定》（国发〔1998〕44号），从2003年《国务院办公厅转发卫生部等部门关于建立新型农村合作医疗制度意见的通知》（国办发〔2003〕3号）的公布到2007年国务院颁布《关于开展城镇居民基本医疗保险试点的指导意见》（国发〔2007〕20号），我国在不同的历史时期建立了针对不同人群的医疗保险制度。随着经济社会的发展，城乡分隔的制度分设、体制分隔、经办分散的“三分”格局产生了的弊端越来越明显，重复参保、重复补贴、重复建设的“三重”等问题不利于保障公平性、适应流动性和实现可持续性。

城乡医保整合工作是一项系统工程，按照3号文的要求，在基本政策层面实现“六统一”。纵观各地的整合实践，基本按照“筹资就低不就高，待遇就高不就低，目录就宽不就窄”的原则，平滑处理两项制度的差异，实现制度平稳的并轨，增强了参保人员的获得感。具体体现为：

在 统一覆盖范围方面，打破城乡二元身份界限，实现城乡居民医保制度的全覆盖。

在 统一筹资政策和待遇水平的方面，实现均衡筹资负担和提高报销比例。大部分地区采取一制一档的方式；部分经济发展水平差异大的地区，在原有筹资和待遇差距大的情况下，采取一制多档的方式。整体而言，制度调整实现农村居民医保待遇的提升，例如上海农村居民待遇水平提升了20%，北京提高了30%左右。

在 统一医保目录方面，坚持就宽不就窄的原则，统一扩大了参保人员的临床用药选择。例如河北、山东、广东，基本实现了医保目录的翻倍增加。

在 统一定点管理方面，打破了区县条块分割，新农合由原来的县级统筹到整合后的市级统筹，在市级范围内统一定点，实现了定点范围的普遍扩大，例如北京地区，新农合由原来的800多家定点医疗机构，整合后全市城乡可达到3000多家。在统一基金管理方面，城乡统筹以及市级统筹的实现，提高了基金的保障能力和抵御风险能力。

在经办层面，按照精简、统一、效能原则，实行“编随事走，人随编走”整合经办资源，实现“一个机构、一支队伍、一个系统、一张卡和一站式结算”，为全民提供高效便捷的服务，提升了管理服务效能。同时，按照“标准统一、资源共享、数据集中、服务延伸”的要求整合信息系统，利用信息系统推进智能监控和实时审核，监控的重点由机构向医务人员的医疗行为延伸，实现信息共享，支撑科学化、精细化管理。