超声检查主要查的是形态学异常，很多疾病早期脏器形态无明显变化（如各种肾病早期肾脏大小形态没有异常，胰腺炎早期超声无特意表现等）。此外，受分辨率、检查的局限性影响，超声并不是万能的（对肺、骨、胃、肠等脏器检查尤其受限，虽然现在胃肠超声造影检查已经广泛开展，肌肉骨骼超声专业也有了发展，但受检查条件和医师经验限制，这些部位的检查还是最好采取已经很成熟的其他影像学检查）。尤其是急诊检查，对胃肠的检查也仅限于提示或排除穿孔（膈下游离气体，腹腔积液等间接征象）、肠梗阻、肠套叠、比较大的胃肠肿瘤（检查效果绝对无法和胃镜肠镜比较）等，以及观察胃的充盈排空情况。所以如果超声提示正常，但有明显症状的患者应该继续做其他检查。